企业“黑箱”困难起因为学界对新古典经济学的生产理论的批评，其实质是企业理论对企业内部组织方式、生产举动的解释力困难。企业理论要想打开企业的“黑箱”，起码需要回答下方两个基本困难：第一， 究竟是什么决定了企业的成长，其成长的活力机制是什么；第二，究竟是什么决定了企业的异质性，即不同企业之间竞争优势的来源。
在现代经济学中，占统治地位的新古典学派一直把企业看作一个“黑箱”（此处“黑箱”之说并无贬义），即企业是一个与消费者处在同等地位的，在市场和技术的约束下追求利润最大化的基本面单位。黑箱理论把企业的一切构成要素都看作是企业资本的一部分，着眼于资本以内部流动中升值的功能。企业从市场上吸收、得到财务资源、物质资源、人力资源和信息资源，经历内部配置和加工，使那些资源转化为新的物品，我们称之为产品。企业的产品在市场上以商品的名义显现，通过卖出达到货币回笼和升值，并通过在市场上买入新的财务、物质、人力和信息资源，组织新的配置与加工。这样循环，企业有机会维持生存状态，或达到成长发展。