证券和基金的区别首要在于风险程度的不同、收益情形的不同、投资方式的不同以及构成形式与获取利益方式的不同。一般意义上来说，证券投资所需要的专业知识与技能水平是好于基金投资的。
狭义的基金一般意义上是指公募基金、私募基金公司等发行的基金品种，从广义角度来讲，还涉及创投公司PE基金、证券公司直投基金、上市公司并购基金、私募基金公司股权基金、代表政府职能出资的产业基金、创业投资基金等等；分为契约型、公司型、有限合伙型等首要类型；狭义的证券一般是指股票，广义的说，包含基金、期货、期权、债券、各种衍生品、利率、外汇工具等。
首先，证券与基金的风险程度不同。一般情形下，证券的风险大于基金。
其次，证券与基金的收益情形不同。一般情形下，受于证券广泛拥有更高的风险，所以潜在收益也比基金更高；而同为基金，受于投资的标的不同，其风险大小与收益高低也会有所不同，比如指数跟随性基金的风险就差于股票型基金的风险，就在此时预期收益也差于股票型基金。
第三，证券与基金的投资方式不同。证券投资人绝多部分时期内均是由投资人本身完成买卖操作，而证券投资基金是一种间接的证券投资方式，基金的投资人不再直接参与有价证券的买卖活动，不再直接承受投资风险，而是由专家具体负责投资方向的确定、投资对象的选择。
最后，基金、股票、债券均为有价证券，对它们的投资都是证券投资。基金份额的划分相似于股票:股票是按"股"划分，计算其总资产;基金资产则划分为若干个"基金单位"，投资人按持有基金单位的比例分享基金的升值收益。契约型封闭基金与债券情形类似，在契约期满后一次收回投资。此外，股票、债券是证券投资基金的投资对象，在国外有专门以股票、债券为投资对象的股票基金和债券基金。