设置零余额账户的方法
省级一级预算单位及无主管部门的行政事业单位，须填写《银行账户审批表》报省财政厅（基层预算单位填写《银行账户审批表》，报主管部门，主管部门还须填写《财政授权支付银行开户情形总览申请表》，连同基层预算单位的《银行账户审批表》一并报省财政厅）；《银行账户审批表》经省财政厅审批后报人民银行，人民银行按规定核发《开户许可证》，预算单位持《开户许可证》，在省财政厅确定的代理银行所属分支机构内，自主选择预算单位零余额账户的开户银行，办理零余额账户开户和印鉴预留手续。
预算单位在改革实行前已由财政拨付的资金，继续在原开设的银行账户中运用和核算；原账户中有关用途的财政资金运用完毕后，重新开设的预算单位零余额账户中按规定支用相关款项。零余额账户的管理和运用
1.财政部零余额账户
财政部零余额账户用于财政直接支付。该账户每日发生的支付，于当日运营终了前与国库单一账户清算；运营中单笔支付额5 000万（含5 000万）元人民币以上的，应及时与国库单一账户清算。财政部零余额账户在国库会计中运用。
2.预算单位零余额账户
预算单位零余额账户用于财政授权开支。该账户每日发生的支付，于当日运营终了前由代理银行在财政部准许的用款额度内与国库单一账户清算；运营中单笔支付额5 000万（含5 000万）元人民币以上的，应及时与国库单一账户清算。财政授权的转账业务一律通过预算单位零余额账户办理。预算单位零余额账户在行政单位会计和事业单位会计中运用。
3.行政事业单位会计中的账务处理
预算单位零余额账户在行政事业单位会计中的账务处理：行政事业单位应设置“零余额账户用款额度”科目。收到“授权支付到账通知书”后，依据通知书所列数额，借记“零余额账户用款额度”科目，贷记“拨入经费”科目或“财政补贴收入”科目。行政事业单位买入物品、服务等支用额度时，借记“经费开支”或“事业开支”、“材料”等科目，贷记“零余额账户用款额度”科目；属于买入固定资产的，同期，应借记“固定资产”科目，贷记“固定基金”科目。行政事业单位从零余额账户提取现金时，借记“现金”科目，贷记“零余额账户用款额度”科目。
4.年度终了，零余额用款额度务必清零
行政事业单位根据代理银行供应的对账单注销额度时，借记“财政应返还额度——财政授权支付”科目，贷记“零余额账户用款额度”科目；假使单位本年度财政授权支付预算指标数大于零余额账户用款额度下达数，依据两者的差额，借记“财政应返还额度——财政授权支付”科目，贷记“拨入经费”或“财政补贴收入”科目。零余额账户的作用
零余额账户的性质决定了其在国库单一账户体系和财政支付管理中具有重要作用，是达到财政集中支付的桥梁。首先，零余额账户是连接国库单一账户与商品或劳务提供商账户的纽带，代理国库单一账户对商品或劳务提供商的支付。财政支付的实质是预算资金从国库单一账户转移到商品或劳务提供商账户，在零余额账户模式下，这一资金转移是通过零余额账户的支付与清算活动达到的，预算开支先由零余额账户向商品或劳务提供商账户支付，然后国库单一账户向零余额账户支付清算，完成整个支付过程。其次，更为重要的是，零余额账户是达到对预算资金最终付款控制的必要的技术手段，是我国国库单一账户制度保证预算资金在事实支付时才流出国库单一账户的一项重要制度安排。零余额账户的零余额特性，致使所有预算资金得以集中控制在国库单一账户，进而克服传统的因分散、重复设置账户而致使的预算资金大批滞留于预算单位以及自此导致的一连串弊端。从这一意义上表达，对零余额账户的有效管理是达到改革目标的核心。
另外，建立国库单一账户体系，实施财政集中支付后，预算单位原有的在商业银行开设的存款账户全会被取消，而零余额账户可以作为这些传统账户的替代，一面兼顾预算单位的传统支付习惯，使预算单位可以根据预算管理权限向零余额账户发出支付命令，履行支付义务，保证为实施预算而采购商品或劳务时作出的支付允诺按时兑现；另一面也能够体当下国库单一账户制度改革中，维持预算管理体制赋予预算单位的管理权限及其会计主体地位不变的改革要求。零余额账户的国际经验
财政集中支付的目的是有效地管好财政开支的最后环节，从制度上保证开支按预算的要求执行支付，而国库单一账户制度的本质，就是国库对预算资金最终付款实施集中控制。具体要求是只有在支付事实发生时，预算资金才流出中央银行国库单一账户，并非是在计划买入或计划开支时，预算资金就已流出国库，进而使国库单一账户能够真实反应财政事实支付情形，提升预算资金运用效益，加强预算资金活动的透明度。在具体达到方式上，国际经验可概括成两种模式：一是全部支付业务直接从中央银行国库单一账户支付到商品或劳务提供商；二是在国库单一账户与商品或劳务提供商之间设置一个过渡性账户或零余额账户，采取由零余额账户支付并与国库单一账户清算的方式达到集中支付。采取设置零余额账户的模式是国际上较广泛的做法，但具体形式各有不同。
在英国和法国，是由负责公共开支的公共会计出纳署为政府部门和其余公共机构开设账户，所有公共开支均通过出纳署，公共部门之间的交易通过出纳署内部划拨执行支付，与非公共部门的交易则通过与商业银行支票转账达到支付。日终，出纳署账户上的余额划拨到中央银行国库单一账户，第二天清晨资金余额再返回出纳署。在意大利和挪威，大额支付业务由中央银行国库单一账户直接支付到商品和劳务提供商，小额或零售支付业务则由财政部门在商业银行开设过渡账户或零余额账户，当财政向代理行发出支付命令，代理行垫款支付到商品或劳务提供商，日终账户余额与中央银行国库单一账户清算。其中意大利是在办理支付３天后向中央银行国库单一账户清算，挪威则是在当天清算。同期，零余额账户还贷记政府收入，所以，日终该账户与国库单一账户清算的余额是借、贷方轧差余额。在巴西，财政在商业银行开设零余额账户，代理行在收到支付命令的第二天将应付资金与中央银行的国库单一账户执行清算，然后将资金划拨入商品或劳务提供商账户。
