福州市商业银行成立于1996年12月27号，是经福州市政府答应，由中国人民银行总行准许，在福州市原14家城市信用社和城市信用社联社的基础上，由地方财政、企业法人和个人共同参股组建，具有独立法人资格的福州市第一家地方性股份制商业银行，下辖29家支行和一个总行运营部，实施“总行—支行”扁平式运营管理模式。
到2006年底，福州市商业银行本外币资产总额为223.61亿元，比年初增长87.18亿元，上涨63.9%，是成立时的差不多10倍；本外币各类存款余额为190.20亿元，比年初增长 76.21亿元，上涨66.89%，是成立时的差不多12倍；本外币各类贷款余额为118.50亿元，比年初增长46.10亿元，上涨63.66%，是成立时的差不多14倍；存贷比为48.10%；五级分类不良资产率为2.19%，比年初下滑了1.46个百分点；不良贷款率为2.92%，比年初下滑了2.54个百分点，较年度计划低2.08个百分点，达到“双降”；全年达到账面利润2.75亿元，同比增长2.06亿元，上涨298.6%，完成年度计划的183.30%。
福州市商业银行先后于2003年6月、2004年8月、2005年6月在私营经济发达、外向型经济活跃、中小企业密集的长乐市、连江县和福清市设立了分支机构，执行网点布局的科学规划和网点资源合理配置，更深一步细化金融市场。
2007年5月27号，该行经福建省银监局准许答应，在长乐市金峰镇正式设立支行。