ETF是通过股票组合使其价格行情与特定指数的行情相同，简单的说就是以股票方式交易，获取指数报酬的基金。投资ETF具有买卖方便、低成本、分散投资以及多样化等优势，另一面，投资人也应当认识到投资ETF或许遇到的风险。那么ETF的投资风险有哪些呢？
第一：标的指数的系统风险
依据投资管理理论，投资一档股票的风险包含市场风险和个别企业风险。尽管投资在越多的不同股票上，可通过彼此间的低有关性减弱整体投资管理的风险，并降低个别股票原因对投资管理产生的影响，但总的经济原因所导致的市场风险却无法通过分散投资来给予消弭。
ETF是一个投资指数的工具，所谓的系统风险就是大盘涨跌的风险，一旦下挫的话，投资者就会面对损失，这是必然发生的。但投资者应具备一个观念：适当地承受大盘下挫地风险，才有机会获取指数上涨的利益。
第二：无法超越指数表现
当前在金融市场中，指数化的投资方式已经广泛地被印证是成熟的而且是成功的。整体来说，该种准备追随指数的投资方式，最大的缺点就是在牛市阶段，ETF的投资只能紧贴市场，而难有超越大盘的状况，而在熊市阶段，ETF也会随指数下挫，与共同基金并无不同。另外，受于ETF的买卖如股票一样，都要收取手续费，原先相对低廉的手续费，若买卖过于频繁，反而会变成相对较高的手续费。
第三：追踪误差风险
ETF发行商首要的功能，是在指数管理方面上，务必要让追踪误差降到最低位，并负责产品的规划设计以及便宜的管理费等方式，来吸引大众的投资，其中最首要的工作就在于控制基金与指数间的追踪误差不能过大。正受于基金管理人以最小化追踪误差为其目标，才可保证短、中、长期持有的投资人，能利用ETF来高达与指数差不多统一的投资报酬，或者避险者能利用放空ETF来规避市场风险的影响。另外，最小化追踪误差的目标，也保障市场套利者在套利活动执行的过程中，不会由于追踪误差突如其来的变大或缩减而使获利承受侵蚀。
第四：无法任意更换投资管理
为了紧贴指数行情，ETF的投资管理只有在指数自身作出变动时，才会跟随调整，并没有能像其余积极型基金一样，因某些产业表现逊色而更改其投资管理，也不能因特别看好某些产业，而执行加码的动作。
第五：无法享有直接的股东权力
受于ETF属于基金的投资形态，是通过ETF发行人投资的受益凭证，所以，即便其交易方式与股票完全统一，仍不能将ETF的投资者看为股票投资者。而一般持有股票的股东权利，也多会由ETF的发行人代为行使，比如配股会直接反应在ETF的净值里，至于参与股东会方面，广泛是由基金发行人代为实施的。